シンオウ地方・コトブキシティにあるギンガ団の収蔵庫に、怪盗エレキッドからの予告状が届く。エレキッドの狙いはかつてのギンガ団団長・デンボクにまつわる刀だったが、折しもコトブキシティで開催される剣道大会のため、服部ヘイガニやピカチュウも同地を訪れていた。ヘイガニはエレキッドの変装を見破り、追い詰めていく。時を同じくして、胸に十文字の切り傷がつけられた遺体がコトブキシティで発見され、捜査線上には「ダハッハの商人」と呼ばれるガングロ系ガラル人の男の存在が浮上する。
そして、本編では明かされていない怪盗エレキッドの秘密が明らかに!
そして、本編では明かされていない怪盗エレキッドの秘密が明らかに!
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